V roce 2003 Arnika odstartovala projekt Sovy do škol. Jen za první rok se ho zúčastnilo přes 10 tisíc dětí ze základních škol a pro velký zájem pokračoval i v dalších dvou letech. Během přednášek se děti dozvěděly čím se sovy živí, které druhy sov u nás mohou potkat nebo třeba o kolik stupňů dokážou otočit svoji hlavu (až o 270°). Součástí setkání byly živé sovy ze záchranné stanice pro divoká zvířata. Kromě přednášek o sovách proběhly v rámci projektu také výpravy za sovím houkáním, táborová soustředění a byla realizována putovní výstava „Naše sovy“.

V posledních letech mají ekovýchovné aktivity Arniky podobu nejen přednášek ale hlavně dlouhodobých tématických soutěží, které obvykle trvají celý školní rok. K těm nejpovedenějším lze určitě zařadit soutěže Odpad je surovina, Šetrné papírování nebo nedávno ukončenou Vodu živou.