Chráníme přirozený charakter vodních toků, oponujeme ničení řek ve jménu „ekologické“ vodní dopravy. Podporujeme revitalizace vodních toků a říčních niv a trvale udržitelné využívání říční krajiny.
Ochrana vodních toků je tradičním tématem Arniky od samého založení. Již dvacet let oponujeme výstavbě plavebních stupňů na Labi mezi Ústím nad Labem a státní hranicí. Také se věnujeme kanálu Dunaj-Odra-Labe, jehož myšlenka se čas od čas znovu vynořuje z nebytí.
Osvětou i podporou konkrétních projektů podporujeme revitalizace a renaturace vodních toků, tedy jejich návrat do stavu bližšího přírodě. Jsme totiž přesvědčeni, že přirozené řeky lépe plní nejrůznější ekosystémové funkce, které v konečném důsledku prospívají člověku i přírodě. Nadměrné regulace těžce postihly například schopnost krajiny hospodařit s vodou, a spolu s klimatickou změnou tak zvyšují škody působené suchem i povodněmi. Podporujeme myšlenky obnovení říční kontinuity odstraňováním a zprůchodňováním bariér na vodních tocích.
Doma i v zahraničí podporujeme koupání v řekách, jako zábavnou a příjemnou formu poukazování na význam zdravých a čistých řek a kontaktu s přírodou. V zahraničí pomáháme místním komunitám řeky chránit zejména před masivní výstavbou a devastačním provozem derivačních hydroelektráren na přírodních řekách, které představují v rámci Evropy naprosto unikátní přírodní hodnoty.